2009: Shane Duffy ist U-19, U-17 und U-16 Nationalspieler Nordirlands.

04/2010: Shane Duffy wird in den Kader der irischen A-Nationalmannschaft berufen.

2010: Shane Duffy ist U-21 Nationalspieler für Nordirland.

2012: Shane Duffy ist U21 Nationalspieler für Irland (Ireland under 21 football national team). 

12.09.12: Der FC Everton hat den Vertrag mit dem irischen U21 Nationalspieler Shane Duffy (20) bis zum 30.06.2015 verlängert.

06/2016: Shane Duffy nimmt für Irland an der Fußball-Europameisterschaft (UEFA European Championship 2016) in Frankreich teil.